增值税应纳税额的基本计算公式为：应纳税额=销项税额-进项税额。以下从销项税额和进项税额的计算方法展开说明：销项税额的计算销项税额是纳税人销售货物、劳务等时，按销售额和规定税率计算并向购买方收取的增值税额，计算公式为：销项税额=销售额×税率。
其应纳税额计算公式为：应纳税额 = 销项税额 - 进项税额其中，销项税额 = 不含税销售额 × 适用税率，进项税额指纳税人购进货物、服务等支付的增值税额，需取得合法有效的增值税专用发票方可抵扣。
如果发票金额已包含13%税款，计算公式为：实际需缴纳的增值税 = 含税金额 ÷ （1 + 13%） × 13%。例如，如果含税价为100元，税额计算为：100 ÷ （1 + 13%） × 13% = 150元。 如果是不含税金额，直接按照13%税率计算：增值税税额 = 不含税金额 × 13%。
其应纳税额计算公式为：应纳税额=不含税销售额×征收率例如，小规模纳税人销售货物适用3%征收率时，若不含税销售额为10万元，则应纳税额=10万×3%=3000元。与一般纳税人不同，小规模纳税人无法将取得的增值税专用发票用于进项税额抵扣，其税负计算直接基于销售额和征收率，不涉及进项税额的扣除。
如果你是养殖户或专业合作者社，且销售的海参属于初加工产品，增值税免税；如果你是贸易商且销售的初加工产品，一般纳税人11%税率，小规模纳税人征收率3%；如果销售的深加工产品，不管你是加工商还是贸易商，一般纳税人17%税率，小规模纳税人征收率3%。以上说的税率都是增值税，地税及附加按你企业所在地的税率执行。
一般纳税人取得的海产品3%税率专票，可按发票金额和9%扣除率计算抵扣进项税额；若用于深加工且加工后产品适用13%税率，领用时可加计1%按10%扣除率抵扣。
税局明确：3%的农产品专票可以抵扣9%或10%进项 3%专票抵扣9%或10%进项的具体规定 税局已明确，纳税人购进农产品，从依照3%征收率计算缴纳增值税的小规模纳税人取得增值税专用发票的，可以抵扣进项税额。
财税〔2017〕37号文件规定，一般纳税人从小规模纳税人处取得3%专票，可按发票金额的11%计算抵扣进项税额；财税〔2018〕32号文件将扣除率下调至10%（自2018年5月1日起执行）；财政部 税务总局 海关总署公告2019年第39号进一步将扣除率调整为9%（自2019年4月1日起执行）。
